Основные задачи отдела: 
предупреждение и пресечение коррупционных правонарушений в отрасли; Обеспечение реализации мероприятий, направленных на реализацию проекта «Сектор без коррупции» на отраслевом уровне на уровне высшего учебного заведения;
Внедрение и реализация системы «Комплаенс-контроль» по противодействию коррупции в отрасли;
Выявлять зоны повышенного коррупционного риска в отрасли, причины и условия совершения коррупционных правонарушений;
Предоставление информации о системных проблемах, приводящих к проявлению коррупции в отрасли, и внесение соответствующих предложений по их устранению;
Обеспечение реализации программ, направленных на устранение причин и условий совершения коррупционных правонарушений в отрасли и повышение эффективности мер противодействия коррупции;
координировать общественный контроль, направленный на противодействие коррупции в отрасли, а также проводить антикоррупционный мониторинг на основе современных методов и информационно-коммуникационных технологий;
Изучение общепризнанных международных стандартов и положительного зарубежного опыта в сфере противодействия коррупции и общественного контроля, разработка предложений по внедрению передовых аспектов;
Организация проведения социологических, научных и иных исследований и разработка предложений по вопросам состояния, тенденций и причин коррупции в отрасли, а также эффективности мер противодействия коррупции;
Координация деятельности образовательных учреждений, подведомственных филиалу, по противодействию коррупции.